Copio del "Diccionario crítico de dudas inglés-español de medicina" de Fernando A. Navarro (2.ª edición); Madrid: Mc Graw Hill-Interamericana, 2005:

/natural history/. La historia natural es, para nosotros, la ciencia que estudia los tres reinos de la naturaleza: el reino animal, el reino vegetal y el reino mineral. Los médicos de habla inglesa suelen utilizar la expresión /natural history/ para referirse a lo que nosostros llamamos 'evolución natural' o 'evolución espontánea' de una enfermedad. □ /The natural history of ichtyosis is characterized by exacerbations and remissions (la evolución natural de la ictiosis se caracteriza por la sucesión de fases de empeoramiento y fases de remisión).

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Note added at 4 horas (2008-06-21 11:53:20 GMT)
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Me olvidé de decir que, por influencia del inglés (as usual...), la expresión "historia natural" también ha invadido nuestro lenguaje médico.

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Note added at 5 horas (2008-06-21 12:31:29 GMT)
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Algunos ejemplos de textos en los que puede comprobarse la equivalencia de las expresiones "natural history" y "evolución natural":

http://www.oftalmo.com/estrabologia/rev-06-1/r07.htm

http://www.revistanefrologia.com/mostrarfile.asp?ID=734

http://www.alcem.org.ar/Notas/notas57.pdf

http://content.nejm.org/cgi/content/spanish_abstract/356/23/...

http://www.intramed.net/actualidad/art_1.asp?contenidoID=474...

(En los dos últimos ejemplos, los traductores "se animaron" a traducir "natural history" por "evolución natural".)